Юрий Коротков написал сценарий по мотивам нескольких событий, произошедших в ходе Афганской войны. Основной темой стал бой у высоты 3234. В 1988 году девятая рота 345 гвардейского отдельного парашютно-десантного полка выстояла оборонительный бой за господствующую высоту над дорогой Гардез-Хост. В обороне высоты участвовало 39 человек, 6 из которых погибли. Перед съёмками актёров консультировали ветераны-афганцы из той самой девятой роты.

«9 рота», т/к СТС, Art Pictures Group, 2005, реж. Ф. Бондарчук

Съёмки были масштабными и затратными. В съёмочном процессе участвовало четыре страны — Россия, Украина, Узбекистан и Финляндия. Было задействовано 18 географических объектов, вся военная техника была предоставлена министерствами обороны стран. Причем, всю технику пришлось перекрашивать под расцветку 80-х годов, для чего в Симферополе скупили почти все запасы акриловой краски — всего примерно тонну. Реквизит собирали в разных странах, в том числе и в Афганистане, где закупали костюмы для «моджахедов».

«9 рота», т/к СТС, Art Pictures Group, 2005, реж. Ф. Бондарчук

Самой сложной сценой стал взрыв афганского кишлака. Четыре месяца съёмочная группа на двух гектарах земли возводила классический восточный кишлак с глиняными домами. Дело осложнялось постоянными туристами — «афганский городок» находился рядом с Коктебелем и привлекал внимание отдыхающих. В день, когда кишлак должен был быть взорван, неожиданно испортилась погода и съёмки пришлось перенести. Оставлять на ночь «кишлак» с 9 тоннами взрывчатки было опасно для случайных туристов, поэтому часть группы до утра охраняла постройки… На следующий день на гору были отправлены члены бригады, которые передавали сведения о просветах между облаками. Как только появился достаточно большой кусок чистого неба — кишлак быстро взорвали.

«9 рота», т/к СТС, Art Pictures Group, 2005, реж. Ф. Бондарчук

В сцене со стариком-афганцем и походом Джоконды за спичками снималась пожилая ослица Люся, которая когда-то возила Шурика в «Кавказской пленнице…». Съёмочная группа «9 роты» пришла в Ялтинский зоопарк и объяснила, что им нужен осел, который не боится камеры, людей и громких звуков. Им привели Люсю, сказав, что лучшего варианта не найти — она опытная актриса и справится с любой ролью. Ослица не подвела.

«9 рота», т/к СТС, Art Pictures Group, 2005, реж. Ф. Бондарчук

Специально для фильма звукорежиссер Кирилл Василенко записал порядка 20 часов разнообразных шумов — стрелковое оружие, крупноколиберное оружие, вертолеты, танки, звуки казармы, БТРы, минометы, ГРАДы. Трое людей в Москве записывали атмосферные шумы, в Питере монтировали выстрелы и взрывы, звуками рикошетов занимался специальный человек в Австралии. Сборка всего шумового материала происходила в Лондоне, на британской студии, которая работала над «Ватерлоо» Сергея Бондарчука.

«9 рота», т/к СТС, Art Pictures Group, 2005, реж. Ф. Бондарчук